SciELO - Scientific Electronic Library Online

 
vol.91 suppl.1Bronchodilator drugsPrimary care protocol and emergency areas for 1-24-month-old infants with broncho obstructive syndrome author indexsubject indexarticles search
Home Pagealphabetic serial listing  

Services on Demand

Journal

Article

Related links

Share


Archivos de Pediatría del Uruguay

Print version ISSN 0004-0584On-line version ISSN 1688-1249

Arch. Pediatr. Urug. vol.91  supl.1 Montevideo Dec. 2020  Epub Dec 01, 2020

http://dx.doi.org/10.31134/ap.91.s1.3 

Pautas

El laboratorio de microbiología en la estrategia de atención de niños hospitalizados por infecciones respiratorias agudas bajas

The role of the microbiology laboratory in the caring of hospitalized children with severe low respiratory infections

O papel do laboratório de microbiologia na estratégia de atendimento de crianças hospitalizadas por infecções respiratórias agudas inferiores

1Prof. Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR.

2Prof. Agdo. Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR.

3Prof. Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR.

4Prof. Unidad Cuidados Intensivo de Niños. Facultad de Medicina. UDELAR.

5Prof. Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR.

6Prof. Agda. Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR.

7Prof. Adj. Medicina Familiar. Facultad de Medicina. UDELAR.

8Adj. Dirección HP-CHPR. ASSE.

9Coordinadora Plan Invierno. HP-CHPR. ASSE.

10Supervisora Área UCIN. HP-CHPR. ASSE.

11Depto. Enfermería. HP-CHPR. ASSE.

12Lic. Enf. Depto. Enfermería. HP-CHPR. ASSE.

13 Prof. Adj. Cátedra Pediatría Intensiva de Niños. Facultad de Medicina. UDELAR.

14Asistente Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR

15Supervisora CREA. HP-CHPR. ASSE.

16Supervisora CREA. HP-CHPR. ASSE.

17Asistente Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR.

18Lic. Enf. Comité Infección Intrahospitalaria. HP-CHPR. ASSE.

19Prof. Agda. Clínica Pediátrica. Facultad de Medicina. UDELAR.

20Adj. Dirección General CHPR. ASSE.

21Médico. Depto. Patología Clínica. HP-CHPR. ASSE.

22Médico. Depto. Patología Clínica. HP-CHPR. ASSE.

Introducción

El Departamento de Patología Clínica y el Laboratorio de Microbiología del Centro Hospitalario Pereira Rossell han acompañado a los demás sectores del hospital en las acciones del Plan de Invierno.

En el año 1998 se realizó un Plan Piloto, en colaboración con el Departamento de Bacteriología y Virología de la Facultad de Medicina, Universidad de la República, y se comenzaron a estudiar los agentes virales causantes de infecciones respiratorias en niños hospitalizados por técnicas de inmunofluorescencia. En 1999, se incorporó la investigación sistemática del diagnóstico viral en estos pacientes. En el 2000, se comenzó a realizar la investigación de antígenos virales en el Laboratorio de Microbiología del CHPR, utilizando ensayos inmunocromatográficos. En 2016 se incorporaron en este laboratorio técnicas de detección de ácidos nucleicos.

Técnicas implementadas

Detección de antígenos virales. Realizada en secreciones respiratorias que se obtienen mediante un aspirado nasofaríngeo (ANF) por técnica inmunocromatográfica. Los virus estudiados fueron influenza A y B, virus respiratorio sincicial (VRS) y adenovirus.

La técnica de inmunocromatografía tiene una sensibilidad entre 50% y 80%, y una especificidad que varía entre 70% y más de 90%. Estos valores surgen de estudios y revisiones publicados que en general fueron realizados de cada virus en forma independiente. La mayoría de las publicaciones se refieren fundamentalmente a influenza A y B y VRS, y en menor cantidad a adenovirus. Los estudios que informaron mejor comportamiento para influenza refirieron una especificidad cercana a 100%, con numerosos falsos negativos. Las investigaciones sobre VRS informaron valores elevados de especificidad, con sensibilidad más elevada que para influenza, pudiendo alcanzar 80%1-9.

El rendimiento de esta técnica está influenciado por cambios que ocurren en la prevalencia de los virus (circulación estacional), variaciones en las cepas virales circulantes, el tiempo transcurrido desde el comienzo de la enfermedad hasta el momento de recolección de la muestra (las muestras precoces tienen mejor performance que las tardías), el tipo y calidad de la muestra respiratoria (los aspirados nasofaríngeos son mejores muestras que los hisopados nasales o faríngeos), la edad (los niños tienen mayor carga viral que los adultos y los niños pequeños tienen cargas superiores que los más grandes), y finalmente la severidad de la enfermedad1-9.

Detección de ácidos nucleicos. Esta técnica se incorporó en 2016. Se realiza en una plataforma cerrada que detecta ácidos nucleicos de patógenos que causan infecciones respiratorias. Esto ha permitido, en algunos casos, identificar agentes que no se estaban estudiando, así como confirmar o descartar resultados de difícil interpretación, como coinfecciones o casos de influenza al inicio de los empujes epidémicos. Las muestras estudiadas se recogen en medio de transporte viral. Esta plataforma (FilmArray, Biofire) detecta 20 agentes vin culados a infecciones respiratorias, 17 virus y 3 bacterias (Tabla 1)10.

Tabla 1: Agentes de infecciones respiratorias detectados por detección de ácidos nucleicos. 

En la (Tabla 2) se describen las ventajas y desventajas de las técnicas directas para diagnóstico virológico.

Tabla 2: Ventajas y desventajas de las técnicas directas de diagnóstico virológico. 

Recursos humanos y materiales, logística

La realización de estas técnicas requiere recursos humanos especializados y entrenados (licenciados en laboratorio clínico, auxiliares técnicos de laboratorio).

Durante los meses fríos del año el aumento en la demanda de estas técnicas determina un incremento muy importante en los insumos necesarios. Dicho aumento también modifica la logística del Laboratorio de Microbiología, que debe extender su horario de funcionamiento, dar prioridad a áreas críticas y acortar los tiempos de espera de resultados.

Bibliografía:

1. Landry M, Cohen S, Ferguson D. Real-time PCR compared to Binax NOW and cytospin-immunofluorescence for detection of influenza in hospitalized patients. J Clin Virol 2008; 43(2):148-51. [ Links ]

2. Rahman M, Vandermause M, Kieke B, Belongia E. Performance of Binax NOW Flu A and B and direct fluorescent assay in comparison with a composite of viral culture or reverse transcription polymerase chain reaction for detection of influenza infection during the 2006 to 2007 season. Diagn Microbiol Infect Dis 2008; 62(2):162-6. [ Links ]

3. Chartrand C, Leeflang M, Minion J, Brewer T, Pai M. Accuracy of rapid influenza diagnostic tests: a meta-analysis. Ann Intern Med 2012; 156(7):500-11. [ Links ]

4. Bruning A, Leeflang M, Vos J, Spijker R, de Jong M, Wolthers K, et al. Rapid tests for influenza, respiratory syncytial virus, and other respiratory viruses: a systematic review and meta-analysis. Clin Infect Dis 2017; 65(6):1026-32. [ Links ]

5. Fujimoto T, Okafuji T, Okafuji T, Ito M, Nukuzuma S, Chikahira M, et al. Evaluation of a bedside immunochromatographic test for detection of adenovirus in respiratory samples, by comparison to virus isolation, PCR, and real-time PCR. J Clin Microbiol 2004; 42(12):5489-92. [ Links ]

6. Romero M, López R, González R, Ots C, Hierro S, Martín M, et al. Immunochromatographic test for detection of adenovirus from respiratory samples: is it a real solution for pediatric emergency department? J Virol Methods 2014; 195:236-9. [ Links ]

7. Romero M, González M, Hierro S, Gutiérrez A. Evaluación de un nuevo método de inmunocromatografía para la detección rápida de adenovirus en muestras respiratorias de pacientes pediátricos. Enferm Infecc Microbiol Clin 2008; 26(9):598-9. [ Links ]

8. Marimón J, Navarro J. Métodos de diagnóstico rápido de las infecciones respiratorias. Enferm Infecc Microbiol Clin 2017; 35(2):108-15. [ Links ]

9. Centers for Disease Control and Prevention. Evaluation of 11 commercially available rapid influenza diagnostic tests-United States, 2011-2012. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2012; 61(43):873-6. [ Links ]

10. Miernyk K, Bulkow L, DeByle C, Chikoyak L, Hummel KB, Hennessy T, et al. Performance of a rapid antigen test (Binax NOW(r) RSV) for diagnosis of respiratory syncytial virus compared with real-time polymerase chain reaction in a pediatric population. J Clin Virol 2011; 50(3):240-3. [ Links ]

Nota: Catalina Pírez, Gabriel Peluffo, Gustavo Giachetto, Amanda Menchaca, Walter Pérez, Héctor Telechea, Fabiana Morosini, Rosario Taboada: Médico Pediatra. Catalina Pírez: Integrante Depto. Pediatría y Especialidades. ASSE. Karina Machado: Médico Pediatra Coordinadora Asistencial Depto. Pediatría y Especialidades. Natalia Cristoforone: Médico. Especialista Medicina Familiar. Directora HP. CHPR. Mariela Alamilla, Victoria Acosta, Mabel Bruneto, Bárbara Toscano: Licenciada Enfermería Héctor Telechea: Médico Pediatra. UCIN. María Assandri: Unidad Gestión de camas. HP. CHPR. Bárbara Toscano: Unidad Capacitación. HP. CHPR. Eduardo Rompani, Martín Notejane: Médico Pediatra CREA. HP. CHPR. ASSE. Mónica Pujadas: Médico. Pediatra. Comité Infección Intrahospitalaria. HP. CHPR. ASSE. Pedro Cladera: Médico. Especialista Patología Clínica. Ex Jefe Depto. Patología Clínica. HP. CHPR. ASSE. Gabriela Algorta, Adriana Varela: Médico, Laboratorio Microbiología.

Nota: Colaboradores que suministraron información para este manuscrito: Clínicas Pediátricas. Dpto Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. Elizabeth Assandri. Médico. Pediatra. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0001-5071-9062 Federica Badía. Médico. Pediatra. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0003-1434-6048 Nancy de Olivera. Médico. Pediatra. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0001-7682-7109 Margarita Halty. Ex Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0003-0316-9269 Soledad Pandolfo. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0003-1933-2198 Lorena Pardo. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0002-4827-5893 Martín Vázquez. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0002-7916-167X Alejandra Vomero. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0002-4796-2624 Cristina Zabala. Prof. Adj. Clínica Pediátrica. Depto. Pediatría. Facultad de Medicina. UDELAR. 0000-0003-3413-7083 Carmina Alcaraz. Lic. Registros Médicos. Jefa Dirección Registros Médicos. HP. CHPR. ASSE. 0000-0002-7239-8826

Nota: Todos los autores declaran haber colaborado en forma significativa.

Nota: Este trabajo ha sido aprobado unánimemente por el Comité Editorial.

Creative Commons License Este es un artículo publicado en acceso abierto bajo una licencia Creative Commons